Adviescommissie
Voor de behandeling van bezwaren tegen besluiten van de CRT die direct of indirect betrekking hebben op een registratie als specialist is een onafhankelijke adviescommissie ingesteld (artikel 7:13 Awb). Deze commissie adviseert de CRT over het al dan niet gegrond verklaren van het bezwaar. De adviezen zijn niet bindend. Als de CRT in de beslissing op bezwaar afwijkt van het advies, moet zij dit wel motiveren.
Commissie van Beroep
De Commissie van Beroep is ingesteld om beroepschriften van aanvragers van accreditatie te behandelen. Zij beoordeelt zaken tegen beslissingen op bezwaar van de Accreditatiecommissie. Wanneer een aanvrager het niet eens is met een beslissing op bezwaar, kan hij binnen zes weken beroep instellen. Het instellen van beroep schorst de werking van het besluit niet. De commissie beslist binnen twaalf weken en kan het besluit (deels) vernietigen als het beroep gegrond wordt verklaard.